Die Reformierte Kirche Wallisellen arbeitet regional besonders eng mit der
Reformierten Kirche Opfikon zusammen. Einzelne Mitarbeitende arbeiten in beiden Kirchgemeinden. Zudem arbeiten die beiden Kirchgemeinden im Rahmen einzelner Angebote punktuell zusammen.
Etwas loser und informeller steht die Reformierte Kirche Wallisellen mit den anderen Kirchgemeinden des Hardwald:
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Reformierte Kirche Bassersdorf-Nürensdorf
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Reformierte Kirche Dietlikon
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Reformierte Kirche Kloten
Auf kantonaler Ebene ist die Reformierte Kirche Wallisellen Teil der
Reformierten Kirche Kanton Zürich.